生物信息学研究员/高级研究员

上海医药集团股份有限公司

  • 上海市浦东新区
  • 长期
  • 全职
  • 2天前
岗位职责:1、基于AI预测模型(如AlphaFold-Drug)优化可切割/不可切割连接子结构,建立payload(微管抑制剂、DNA损伤剂等)的毒性-稳定性量化评估体系;2、通过结构生物信息学(Rosetta、HADDOCK)设计抗体突变体,提升亲和力、降低免疫原性;建立抗体-FcγR相互作用预测流程,优化ADCC/CDC效应;3、应用深度学习(Epitope3D、BepiPred-3.0)解析靶点-抗体结合界面,指导表位定向改造;开发多物种交叉反应性评估模型,降低临床前物种差异风险;4、主导单细胞测序(10x Genomics、Nanostring)数据分析,识别预测ADC疗效的肿瘤微环境特征;构建基于WES/RNA-seq的耐药性标志物筛查流程;5、整合TCGA、DepMap等数据库,建立靶点"可药性-肿瘤特异性-临床关联性"三维评估模型;开发跨膜蛋白的胞外域结构预测工具;6、负责多组学数据(如基因组、转录组、代谢组、蛋白质组等)的深度挖掘与分析;根据项目需要制定项目方案、编写生信分析代码、程序测试,负责撰写相关软件文档。岗位要求:1、生物信息学、计算生物学、生物学、计算机科学、统计学、人工智能或相关专业硕士及以上学历,3年以上相关工作经验;2、熟练使用Linux系统,至少精通两门编程语言(Python/R/Perl),具备生物信息学算法开发经验;熟练掌握抗体药物或抗体蛋白的相关数据特点和分析流程,能运用相关工具如BWA、GATK、STAR等进行数据处理;3、有ADC药物开发实际项目经验者优先,包括抗体筛选、linker设计、payload优化、抗体工程改造、酶的定向进化等方面的生物信息学经验;4、良好的团队合作和跨部门沟通能力,与实验团队紧密合作,准确解读分析结果,为药物研发提供有力的数据支持;能够与实验科学家、药物化学家、临床医生等多学科团队成员有效沟通和合作;5、有良好的统计分析能力;6、具备良好的英语读写能力,能够阅读和理解英文文献、法规文件等资料、撰写英文报告等。

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